Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNL1Q9UK58 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms