Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUF60Q9UHX1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PUF60Q9UHX1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms