Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX25Q9UHL0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX25Q9UHL0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms