Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MLH3Q9UHC1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
MLH3Q9UHC1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms