Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO40Q9UH90 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO40Q9UH90 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms