Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms