Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN8Q9UBY8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN8Q9UBY8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms