Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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