Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DKK2Q9UBU2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms