Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP28Q9P2N2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGAP28Q9P2N2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP28Q9P2N2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms