Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms