Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP36Q9P275 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP36Q9P275 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP36Q9P275 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms