Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP5Q9NZZ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP5Q9NZZ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms