Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EHD3Q9NZN3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EHD3Q9NZN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms