Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS1Q9NYS0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms