Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSMCE4AQ9NXX6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms