Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT57Q9NWB7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFT57Q9NWB7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT57Q9NWB7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms