Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARVAQ9NVD7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARVAQ9NVD7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms