Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC3Q9NUV7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTLC3Q9NUV7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms