Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACER3Q9NUN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACER3Q9NUN7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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