Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCP11L1Q9NUJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCP11L1Q9NUJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms