Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMSN1Q9NSI8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMSN1Q9NSI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms