Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A13Q9NSD5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A13Q9NSD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms