Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF275Q9NSD4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms