Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX15Q9NRS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX15Q9NRS6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX15Q9NRS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms