Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF3Q9NR81 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF3Q9NR81 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms