Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INCENPQ9NQS7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INCENPQ9NQS7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms