Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCUBE2Q9NQ36 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCUBE2Q9NQ36 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms