Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD93Q9NPY3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD93Q9NPY3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD93Q9NPY3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD93Q9NPY3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD93Q9NPY3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD93Q9NPY3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD93Q9NPY3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD93Q9NPY3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms