Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4BQ9NPR2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms