Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2TQ9NPD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2TQ9NPD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2TQ9NPD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2TQ9NPD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms