Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB9BQ9NP90 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB9BQ9NP90 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms