Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL47Q9HD33 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL47Q9HD33 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms