Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRMS1Q9HCU9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRMS1Q9HCU9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms