Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPV4Q9HBA0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPV4Q9HBA0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms