Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LIN28AQ9H9Z2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms