Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C10orf88Q9H8K7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms