Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SENP3Q9H4L4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SENP3Q9H4L4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms