Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX5Q9H2C1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX5Q9H2C1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX5Q9H2C1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms