Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SDCBP2Q9H190 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDCBP2Q9H190 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms