Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC8Q9H0W5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC8Q9H0W5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC8Q9H0W5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms