Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND12Q9H0C1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND12Q9H0C1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms