Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2OQ9C0C9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms