Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT23Q9C075 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT23Q9C075 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms