Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms