Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXQ1Q9C009 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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FOXQ1Q9C009 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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