Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RNF17Q9BXT8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RNF17Q9BXT8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms