Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYCP2Q9BX26 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYCP2Q9BX26 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms