Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA5Q9BWX5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GATA5Q9BWX5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GATA5Q9BWX5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATA5Q9BWX5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms