Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
REPIN1Q9BWE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms